首先，它可以通過和解來處理。如果和解不成功，可以要求第三方機構(gòu)介入調(diào)解。如果和解不能調(diào)解，可以收集證據(jù)，向法院起訴解決。只有這樣，法院才能求作出公平公正的判決。

　　(1)和解。

　　和解是當事人在尊重雙方利益的基礎上，就爭議事項達成協(xié)議，解決爭議的一種方式。和解是當事人在自愿原則下自由選擇解決臺灣糾紛的一種方式，而不是解決合同糾紛的必要程序。雙方也可以直接選擇其他方式解決爭議，而無需協(xié)商和解。

　　(2)調(diào)解。

　　調(diào)解是在第三人的主持下，通過說服教育等方式解決當事人之間的合同糾紛。調(diào)解有兩種方式。一是人民調(diào)解委員會調(diào)解當事人的合同糾紛，可以向爭議當事人所在地或者爭議發(fā)生地的人民調(diào)解委員會申請調(diào)解。二是行政調(diào)解。主要是指工商行政管理機關居中調(diào)解合同當事人糾紛。申請行政調(diào)解的爭議，必須具備下列條件：申請人必須是與本案直接相關的當事人，具有明確的被申請人、具體的調(diào)解請求和事實依據(jù)；符合工商行政管理機關受理案件范圍的規(guī)定。但是已向人民法院起訴或者已向仲裁機構(gòu)申請裁決的。調(diào)解申請不求另一方不同意調(diào)解，調(diào)解申請不予受理。當事人接受調(diào)解達成協(xié)議的，應當作出調(diào)解協(xié)議，當事人應當按照調(diào)解協(xié)議履行各自的義務。由于調(diào)解協(xié)議沒有法律強制力，如果一方不履行，另一方不能要求人民法院強制執(zhí)行，但爭議可以通過其他方式解決。

　　(3)仲裁。

　　仲裁是雙方根據(jù)爭議發(fā)生前后達成的仲裁協(xié)議，將爭議提交仲裁機關裁決解決的方式。“準司法”仲裁機構(gòu)作出的仲裁裁決具有法律效力，當事人應當履行。

　　(4)訴訟。

　　訴訟是指合同糾紛發(fā)生后，當事人沒有仲裁協(xié)議的，任何一方都可以向人民法院提起民事訴訟，要求人民法院依法處理合同糾紛。這是解決合同糾紛最常見的方式。合同糾紛經(jīng)人民法院審理作出判決后，當事人必須履行對人民法院作出的具有法律效力的判決的調(diào)解書。拒不履行的，另一方可以向人民法院申請強制執(zhí)行。

　　建設工程合同糾紛發(fā)生后，可以通過四種方式解決，一般包括和解、調(diào)解、仲裁和訴訟；但是，如果可以在和解或調(diào)解的情況下解決，雙方不需要通過法律程序。因此，他們必須知道如何保護自己的權(quán)益。如果合同糾紛得不到很好的解決，他們的利益就會受到損害。